อุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโป เป็นอุทยานแห่งชาติที่กรมป่าไม้ดำเนินการประกาศจัดตั้งเป็นอุทยานแห่งชาติ ในท้องที่จังหวัดนราธิวาส ซึ่งแต่เดิมนั้นเป็นป่า โครงการไม้กระยาเลย ป่าฝั่งขวาแม่น้ำสายบุรี (นธ.1) เป็นเทือกเขาที่อุดมสมบูรณ์ไปด้วยทรัพยากรป่าไม้และสัตว์ป่า ซึ่งกรมป่าไม้ได้อนุญาต ออป. รับสัมปทานเมื่อปี พ.ศ. 2515 ตามใบอนุญาตฉบับที่ 12/2515 ลงวันที่ 22 กุมภาพันธ์ 2515 ทำไม้กระยาเลย ต่อมารัฐบาลมีนโยบายปิดป่าสัมปทานไปเมื่อปี 2532 จึงทำให้สภาพป่ายังคงมีความอุดมสมบูรณ์ไปด้วยป่าไม้และสัตว์ป่านานาชนิด ประกอบกันอยู่ในพื้นที่เดียวกันกับวนอุทยานน้ำตกซีโป และบริเวณพื้นที่ดังกล่าวเข้าหลักเกณฑ์ในการจัดตั้งอุทยานแห่งชาติ และในการดำเนินการสำรวจจัดตั้งอุทยานแห่งชาติแห่งนี้ ได้ยึดถือแนวป่า โครงการไม้กระยาเลยและป่าฝั่งขวาแม่น้ำสายบุรี (นธ.1) เป็นหลักสำคัญในการดำเนินการกำหนดแนวเขตจัดตั้งและผลการดำเนินการสำรวจพื้นที่ป่าโครงการฯ ผืนนี้ ปรากฏว่ามีพื้นที่ประมาณ 62,500 ไร่ หรือ 100 ตารางกิโลเมตร ซึ่งลักษณะสภาพพื้นที่เป็นป่าสมบูรณ์เป็นป่าต้นน้ำลำธาร เป็นป่าฟื้นฟูทรัพยากรธรรมชาติเป็นป่าแหล่งที่อยู่อาศัยของสัตว์ป่า และพื้นที่ที่คงความอุดมสมบูรณ์ด้วยทรัพยากรธรรมชาติและสิ่งแวดล้อมอย่างมากมาย ดังนั้นอุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโปจึงเป็นพื้นที่ป่าโครงการฯ ที่มีความสำคัญอย่างยิ่งที่ควรจะได้รับการอนุรักษ์คุ้มครอง ดูแลป้องกันรักษาเพื่อคงความอุดมสมบูรณ์ด้วยทรัพยากรป่าไม้และสัตว์ป่า ความหลากหลายทางชีวภาพ ความสมดุลของระบบนิเวศน์วิทยา ความสวยงาม และทัศนียภาพทางธรรมชาติ ความสำคัญทางด้านการศึกษาค้นคว้าวิจัยและนันทนาการและที่สำคัญอย่างยิ่ง เพื่อเป็นสมบัติมรดกของจังหวัดนราธิวาสและมหาชนของประเทศชาติอย่างยั่งยืนถาวรตลอดไป
อุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโป เป็นป่าโครงการไม้กระยาเลยที่ได้ผ่านการพิจารณาเห็นชอบ ขององค์การบริหารส่วนตำบลคุซงญอ อำเภอระแนะ องค์การบริหารส่วนตำบลกาลิซา องค์การบริหารส่วนตำบลเฉลิม องค์การบริหารส่วนตำบลมะรือโบตก อำเภอระแงะ องค์การบริหารส่วนตำบลลาโล๊ะ อำเภอรือเสาะ องค์การบริหารส่วนตำบลเชิงคีรี องค์การบริหารส่วนตำบลซากอ องค์การบริหารส่วนตำบลศรีบรรพต อำเภอศรีสาคร จังหวัดนราธิวาส รวมทั้งได้ผ่านการพิจารณาเห็นชอบของคณะอนุกรรมการป้องกัน และปราบปรามการลักลอบทำลายทรัพยากรป่าไม้ประจำจังหวัดนราธิวาสแล้วเช่นกัน และคณะอนุกรรมการฯ ประกาศกำหนดผืนป่าโครงการไม้กระยาเลย ป่าฝั่งขวาและแม่น้ำสายบุรี (นธ.1) ผืนนี้เป็นอุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโป และที่สำคัญอุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโป ยังได้รับการสนับสนุนและเห็นชอบจากชมรมอนุรักษ์สิ่งแวดล้อม จังหวัดนราธิวาส กลุ่มอนุรักษ์ฯต่างๆ ตลอดได้รับการสนับสนุนและส่งเสริมจากสื่อมวลชนทั้งภาครัฐและเอกชนในรูปแบบต่างๆ อีกมากมาย
อุทยานแห่งชาติน้ำตกซีโป มีอาณาเขตพื้นที่ครอบคลุม 4 อำเภอ 8 ตำบล ได้แก่ ตำบลคุซงญอ อำเภอจะแนะ ตำบลกาลิซา ตำบลเฉลิม ตำบลมะรือโบตก อำเภอระแงะ อำเภอรือเสาะ ตำบลเชิงคีรี ตำบลซากอ ตำบลศรีบรรพต อำเภอศรีสาคร จังหวัดนราธิวาส และมีอาณาเขตติดต่อดังนี้
ทิศเหนือ จด ตำบลลาโล๊ะ อำเภอรือเสาะ จังหวัดนราธิวาส
ทิศใต้ จด ตำบลคุซงญอ อำเภอจะแนะ จังหวัดนราธิวาส
ทิศตะวันออก จด ตำบลมะรือโบตก ตำลบเฉลิม ตำบลกาลิซา อำเภอระแงะ จังหวัดนราธิวาส
ทิศตะวันตก จด ตำบลกาลิซา ตำบลเชิงคีรี ตำบลศรีบรรพต อำเภอศรีสาคร จังหวัดนราธิวาส
แหล่งที่มา : https://www.dnp.go.th/mainnation/nationpark/_private/so20.htm